4 d-proteomics™

随着timsTOF平台的引入,通过使用TIMS耦合UHR-QTOF技术,增加了气相离子分离的额外维度,实现了技术的下一个发展。这导致了从3d蛋白质组学(保留时间,m/z和MS/MS指纹)到4d蛋白质组学™(添加固有的CCS值)的过渡。

4 d-mbr dia-PASEF

4 d-mbr dia-PASEF®:引入4d -蛋白质组学™领域

在timsTOF Pro和timsTOF fleX中添加离子迁移维度比增加灵敏度、选择性和MS/MS采集速度带来更多好处。独特的时间设计允许重复测量所有被检测离子的碰撞截面(CCS)值,这些值可用于进一步提高系统的选择性,从复杂样品和短梯度分析中获得越来越可靠的相对定量信息。

4D-MBR:解决缺值问题

4D-MBR:解决短梯度LFQ实验的缺值问题

DIA是解决价值缺失问题使用最广泛的收购策略。然而,使用它需要构建谱库——当涉及到一种不常见的生物时,这可能是及时和困难的——而且传统的DIA方法太慢,无法与短梯度分析兼容。在这种情况下,PASEF-LFQ提供了速度、灵活性和可靠性。尽管如此,即使使用> 100Hz MS/MS,在每次分析中也可能不会选择某些肽段进行碎片化,特别是在使用短梯度时。

运行间匹配(MBR)方法的开发就是为了解决这个缺少值的问题。MBR提取所有多肽的强度信息,使用狭窄的m/z和保留时间窗口进行量化。这种过滤器的组合,先前被认为不够具体,导致不准确的比率测量。4D-MBR增加了一个额外的CCS过滤器的第一个m/z和保留时间,允许更大的特异性,如我们的应用说明151年质

4D-MBR应用于高通量血浆蛋白质组学结果,对192例患者和20个QC血浆样品进行定量,使用Evosep One LC系统以11.5 min梯度分离。(点击放大)

dia-PASEF

dia-PASEF®:将DIA分析提升到下一个层次

DIA与PASEF的结合®可以弥补传统DIA的缺陷:通过在连续的timevent中使用m/z隔离窗口的模式,在DIA - pasef中使用的离子的百分比®可大大提高(对于低复杂度样本可达100%,对于高复杂度样本,仍比使用相同隔离窗口大小和m:z范围的传统DIA方法高5倍)。的dia-PASEF®可以缩短循环时间,使其与短梯度分离兼容,同时保持高选择性。它得益于时间空间浓度效应,可以提高灵敏度,并将DIA选择性提高到下一个水平,完全支持4d -蛋白质组学™。

dia-PASEF®数据可以使用越来越多的不同软件解决方案进行处理:这包括DIA-NN, Spectronaut, MaxQuant, Skyline, PEAKS。

通过阅读我们的申请说明了解更多120年质157年质160年质167年质而且170年质