在timstof Pro和timstof Flex中增加离子迁移率尺寸比提高灵敏度,选择性和MS/MS采集速度的好处更多。唯一的TIMS设计允许可重复测量所有检测到的离子的碰撞横截面(CCS)值,并且可以使用这些值来进一步提高系统的选择性,从而从复杂的样本和短梯度分析中实现越来越可靠的相对定量信息。
DIA是解决缺失价值问题的最广泛使用的采集策略。但是,使用它需要构建光谱库 - 当它涉及不常见的生物时,这可能是及时和困难的 - 传统的DIA方法太慢,无法与短梯度分析兼容。在这种情况下,PASEF-LFQ可提供速度,灵活性和可靠性。尽管如此,即使使用> 100Hz MS/MS,也可能不会在每个分析中选择某些肽进行碎片化,尤其是在使用短梯度时。
已经开发了运行(MBR)方法之间的匹配,以解决此缺失的价值问题。MBR提取强度信息,用于使用狭窄的M/Z和保留时间窗口来量化所有肽。过滤器的这种组合(以前认为不是足够特异性)导致比率测量不准确。4D-MBR在第一个m/z和保留时间添加了额外的CCS过滤器,允许更高的特异性,如我们的申请注释中所示LC-MS 151。
DIA与Pasef的组合®允许补偿传统的DIA陷阱:通过在连续的TIMS事件中使用M/Z隔离窗口的模式,DIA-PASEF中使用的离子百分比®可以大大增加(对于低复杂性样本,最高可达100%,并且使用可比的隔离窗口尺寸和M:Z范围的传统DIA方法比传统的DIA方法高5倍)。Dia-pasef®可以减少周期时间,使其与短梯度分离兼容,同时保持高选择性。它受益于TIMS空间浓度效应,从而可以提高灵敏度,并通过完整的4D-Proteomics™支持将DIA选择性提高到一个新的水平。
仅用于研究。不用于临床诊断程序。