4 d-proteomics™

离子迁移率的维度timsTOF Pro和timsTOF fleX提供更多的好处比增加灵敏度,选择性和MS / MS采集速度。独特的蒂姆斯设计允许反复测量碰撞截面为所有检测离子(CCS)值,和那些可以用来进一步提高系统的选择性,使越来越多的可靠的相对定量信息从复杂样品和短梯度分析。

DIA是应用最广泛的收购战略解决缺失值问题。然而,使用它需要光谱库的建设,可以及时的和困难的问题时一个罕见的生物——和传统DIA方法太慢兼容短梯度分析。在这种情况下,PASEF-LFQ运送速度、灵活性和可靠性。尽管如此,即使在> 100 hz MS / MS,一些肽可能不会选择分散在每一个分析,特别是在使用短渐变。

之间的匹配运行(MBR)方法开发解决这个缺失值问题。MBR所有肽的提取强度信息量化使用窄m / z和保留时间窗口。这种组合的过滤器,以前认为是不够具体,导致不准确的比例测量。4 d-mbr添加了一个额外的CCS滤波器第m / z和保留时间的允许使用更大的特异性见我们的应用程序151年质。

与PASEF DIA的结合^®可以弥补传统DIA陷阱:通过使用的m / z隔离模式窗口内连续蒂姆斯事件、dia-PASEF中使用的离子的百分比^®可以大大增加(达到100%低复杂度样本,还有5 x高于传统DIA方法使用类似隔离窗大小和m: z范围高复杂性的样品)。的dia-PASEF^®可以减少周期时间,让它兼容短梯度分离,同时保留高选择性。它受益于商旅空间浓度效应,允许增加灵敏度,DIA选择性更上一层楼,4 d-proteomics™的支持。

dia-PASEF^®使用越来越多的数据可以处理不同的软件解决方案:这包括DIA-NN, Spectronaut MaxQuant,轮廓,山峰。

了解更多通过阅读我们的应用笔记120年质,157年质,160年质,167年质和170年质。