timsTOF专业2

质谱(MS)的蛋白质组学是识别和量化的方法选择成千上万的蛋白质。然而,蛋白质组的完全覆盖仍然具有挑战性由于有限的速度,当前质谱仪的灵敏度和分辨率。

timsTOF Pro 2使用并行串行碎片(PASEF积累^®)收购方法提供极高的速度和灵敏度,只需要最小的样本数量达到新的深度在蛋白质组学。

被困的离子迁移谱法(蒂姆)首先是分离技术在气相。这解决了样本复杂性通过额外维度的分离除了高效液相色谱(HPLC)和质谱分析,增加对复合特征峰容量和信心。

同样重要的是,蒂姆斯设备也积累和集中离子的质量和流动性,使一个独特的增加灵敏度和速度。

近100%的占空比可以实现dual-TIMS技术促进积累在前面部分,而离子在后面部分发布的顺序取决于他们的机动性。这个过程的并行串行碎片(PASEF积累^®)使碰撞截面(CCS)分析。

CCS-enabled分析开辟了许多进一步分析的可能性,从更大的确定性的化合物鉴定信心库匹配和较低的错误发现率(罗斯福)的大型数据集。

介绍timsTOF Pro 2质谱仪与我们的最新一代蒂姆分析仪和一个完全重做不锈钢叠环离子导(SRIG)。新的设计提供离子能力高出3倍。新的离子离子冷却多极举和改进的离子注入四极一起进一步简化离子光学商旅更高效的离子转移的细胞TOF分析器,进一步最大化离子转移和敏感性女士和PASEF MS / MS。

蒂姆斯细胞的独特设计意味着离子释放的第二部分,蒂姆分析仪根据他们的机动性,而进一步传入的离子可以并行积累的第一部分蒂姆斯分析仪。
这种并行积累技术达到近100%的工作周期,导致几乎没有离子损失。

重新设计的MS / MS技术以满足蛋白质组学的速度要求。使用困离子迁移谱肽离子分离,筛选了(~ 100 ms)和检测四极飞行时间(QTOF),生成蒂姆斯女士热图。在并行串行碎片(PASEF积累^®)方法使用相同的商旅分离:四极隔离某些离子物种在其洗脱,立即转移到下一个先驱。父母和碎片光谱通过流动值是一致的。

PASEF^®技术可以实现测序速度> 100赫兹和丰富的MS / MS谱质量低肽可以增加通过选择他们好几次了。

PASEF^®:适合猎枪蛋白质组学
2由PASEF timsTOF Pro^®提供了一个排序的速度> 100 Hz没有失去灵敏度和分辨率。这是通过同步质量四极隔离窗与特定的肽的洗脱时间包从蒂姆斯漏斗。

最小的清洁要求
许多女士仪器用于蛋白质组学应用程序需要每月清洁一天24小时运行时在大样本人群。bob平台靠谱吗性能退化

明显的甚至在更短的时间。timsTOF Pro的优越的鲁棒性2意味着仪器可以24/7运行许多周没有明显损失的敏感性或其他性能指标。

不是(并行实时搜索引擎)是一种结合硬件和软件解决方案启用完全集成的实时数据库搜索和基于结果的样本队列管理。

不以不妥协的速度交付结果,包括多功能天车搜索。利用基于GPU的搜索,不提供相同的结果在实时或离线模式而不需要利用简化算法或中间体。这毋庸置疑的搜索速度不允许你手头有结果,秒采集结束后,运行&完成了!不是有效的消除了数据分析大样本人群和更高的吞吐量瓶颈。

此外,实时LFQ量化也可以执行跨不了数据集的过渡到定量蛋白质组学瞬时。流动的可视化抵消质量一致(MOMA)功能使用商旅即允许用户立即识别和描述等压和near-isobaric肽4 d-omics只有可见的和可识别的。

dia-PASEF既更敏感和选择性比传统DIA方法PASEF原则适用于独立采集数据,结合DIA的优点与内在离子PASEF效率。

蒂姆斯分离选择性增加,不包括单独控告分裂的前兆和清理的样本集中的信号噪声。

利用相关的分子量和CCS编码信息dual-TIMS漏斗,dia-PASEF使复合识别最有信心。在整个质/ MS dia-PASEF运行创建一个完美的数据立方体的包含m / z,离子迁移率(CCS),保留时间和强度。

健壮SRIG(叠环离子指南)配置和新的优化标准dda-PASEF方法timsTOF Pro 2提供了前所未有的蛋白质组的深度报道在单一的蛋白质组学。从自身的HEK 200 ng在60分钟的胰蛋白酶的消化梯度使用列Aurora-25厘米,超过7000个蛋白质组和60000肽被确定。

timsTOF Pro 2从而提供深入的蛋白质组保险日常细胞株蛋白质组量化实验直接由数据库搜索和匹配之间的运行而不需要任何光谱库。不同的数据库搜索策略导致了非常类似的结果。不是,使实时蛋白质识别和MaxQuant导致类似身份号码蛋白质和肽水平。

标准的选择与平行反应监测(SRM和人口、难民和移民事务局),prm-PASEF肽的数量增加,可以有针对性的在一个采集方法,在不影响选择性和灵敏度。

针对质谱(MS)是一种功能强大的技术,用于蛋白质组学实验,来验证生物标志物候选人在大样本人群,例如。这增加灵敏度相比,数据采集(DDA)的依赖和数据独立收购(DIA)。此技术受限于一个必要的妥协之间目标的数量以一个单一的运行,液相色谱分离阶段的持续时间和总体敏感性。只有可能实现完整的数据大量的目标肽通过运行更长的色谱分离或妥协女士灵敏度和选择性。

prm-PASEF肽的数量增加,可以有针对性的在一个收购受益于第四维度的分离使用力量的timsTOF Pro 2提高选择性和敏感性,增加的速度PASEF增加前体的数量目标。bob电竞安全吗

蛋白质组量化使用低的样本数量是至关重要的,越来越多的生物应用,如特殊细胞,罕见的细胞群,或肿瘤细针吸活组织检查。bob平台靠谱吗如此低的样本数量的蛋白质组量化使用敏感质谱仪是至关重要的。从20 ng的海拉(皮尔斯)肽以Aurora-25厘米列在30分钟的渐变,pas -实时搜索引擎识别超过4200蛋白质组和接近30000肽。

独立采集数据使用标准dia-PASEF在多个运行提供了可再生的识别方法。三种不同dia-PASEF窗口方案允许接近8000的量化蛋白质组和超过70000肽序列在60分钟内梯度使用Aurora-25cm列,同时展示定量精度。

CCS-enabled量化的近端磷酸化网站
高灵敏度,测序速度和再现性的dia-PASEF timsTOF Pro 2甚至使定量phosphoproteomic分析样本数量有限。Label-free量化phosphoproteomes是可行的从25μg总蛋白质从老鼠大脑获得的样本。dia-PASEF富集分析此处则使用30 SPD(每天样品)Evosep方法识别了4473独特的此处则在三个浓缩复制。这些结果进一步承诺为应用程序针活检,补充癌症proteogenomics数据与信号转导的信息。结果是由Stefan Tenzer教授提供。

分析细胞信号样本数量是有限的
在色谱co-elution,量化phospho-peptide (p-peptide)同分异构体是不可能在传统蛋白质组学方法没有CCS信息由于等压自然和信号叠加。PASEF分析从150年标准μg TiO2-based浓缩工作流27768此处则标识,如图所示,揭示了离子迁移与流动分离的好处抵消质量一致(MOMA)。从1946年发现co-eluting同分异构体,20%可能是由蒂姆斯完全分离,使更好的理解近端蛋白质磷酸化位点。