光谱库

bob电竞安全吗Bruker Metabolomics光谱库

通过量身定制的光谱库进行正确的化合物识别,创造更深入的代谢组学见解

自信的识别

布鲁克质谱仪专用图书馆bob电竞安全吗

spectral-libraries

Основныемоменты

MS / MS谱库

谱库用于化合物鉴定的高可信度

信心
高质量的MS/MS光谱测量参考化合物布鲁克质谱仪。bob电竞安全吗
识别
MS/MS谱匹配和准确的前驱体信息可以鉴定已知的化合物。
知识的获得
更多了解在样品中检测到的化合物。
综合的
bob电竞安全吗Bruker MS / MS光谱库包含有关数十万种化合物的信息。

Особенности.

bob电竞安全吗Bruker Metabolomics光谱库

bob电竞安全吗力量MetaboBASE®个人图书馆3.0

质谱库包含相关的内源性和外源性代谢物,使您能够匹配的实验MS/MS谱自动重复。这些光谱库中所包含的化合物的数量是一个重要因素,近年来不断增加,使鉴定出越来越多的已知代谢物。

例如,新版本的bob电竞安全吗力量MetaboBASE®个人图书馆3.0。它包含:

  • 除了内源和外源代谢物之外,衍生自众所周知的梅林(*)复合文库的超过100,000种合成或分离标准的MS / MS光谱,包括二源性和外源代谢物,以研究生物系统中发生的变化。这些数据已在QTOF仪器上获取。已经在Bruker QTOF仪器上获得了来自14,000多个的数据。bob电竞安全吗
  • 在硅内生成的质谱/质谱比233,000种化合物在这个库中,为更快地初步确定尚未作为纯粹参考标准的有关目标铺平了道路。
在不同的碰撞能量下,所有光谱都以正模式和负模式测量,并丢弃了质量较差的光谱。10、20和40 eV的碰撞能量用于硅内库,10/25和25/50 eV的碰撞能量用于其他库。
补充光谱数据包括InCHi、SMILES和CAS标识符和大多数物质的同义词。数据库id和到外部数据库的超链接,包括HMDB、METLIN和PubChem,使您能够快速地将已识别的代谢物引入生物环境。



的力量Mbob电竞安全吗etaboBASE®个人图书馆3.0由众所周知的Gary Siuzdak和Paul Benton博士提供。

* Metlin™是Scripps Research Institute的商标。


注意:Bruker bob电竞安全吗Metabobase®个人图书馆3.0仅支持MetaboScape®4.0更高。

bob电竞安全吗Bruker HMDB代谢物库2.0

重要的不仅仅是光谱的数量,还有库中包含的数据的质量,这对于有信心的识别是非常重要的。
的所有光谱bob电竞安全吗Bruker HMDB代谢物库2.0手动检查去除嘈杂的光谱和污染峰。校正了前体和片段离子以匹配理论质量值和同位素图案分布。

该光谱库的第二个版本提供了更多6000 MS / MS以上光谱800种化合物从人类代谢组数据库(HMDB)和保留时间信息中选择。Bruker HMDB代谢bob电竞安全吗物库2.0的数据使用纯参考标准获得。所有化合物都在冲击系列QTOF高分辨率质谱仪上测量,使用5种不同的碰撞能级。

保留时间信息对于逆向相LC,约600个代谢物增加了进一步正交的信息,以增加在鉴定尿液,血液和其他生物流体中发现的代谢产物的置信度。

T-REX洗脱代谢Metabolomics-kit:RP是一个专用R埃弗斯-PHASE LC列套件,用于使匹配的保留时间与Bruker HMDB代谢物库2.0中的相应值匹配。bob电竞安全吗它还包含用于LC-MS / MS数据采集的方法和标准操作程序(SOP),并且是完整的一部分


T-REX LC-QTOF简化非靶向代谢组学的解决方案。

布鲁克Hbob电竞安全吗MDB代谢物库由布鲁克独家提供,并与加拿大阿尔伯塔大学的李亮教授、David Wishart教授及其团队合作生成。

bob电竞安全吗力量MetaboBASE®植物库

光谱是使用商业标准和假定确定的代谢物发现在模型豆科植物,截断紫花苜蓿。这使植物和食品研究中的代谢物的鉴定成为可能。Brukbob电竞安全吗er Sumner Metabobase®植物库还包含由MS和NMR鉴定的84种化合物的228个光谱。

在BRUKER TIMSTOF仪器上获得的最近添加的碰撞截面(CCS)值超过150种化合物,使得衍生自捕获离子迁移率分离的正交信息匹配。bob电竞安全吗这允许除了前体质量和同位素图案,保留时间和MS / MS光谱之外,还允许基于CCS值鉴定化合物。光谱文库包含在多碰撞能量下获取的光谱,并在ESI负离子模式下获取。对于大多数化合物,提供了分子式的分子式,含有* .mol格式,英寸和微笑的结构。

bob电竞安全吗Bruker Nist 2020质谱库

bob电竞安全吗Bruker Nist 2020质谱库是美国国家标准与技术协会(NIST)的产品,由布鲁克重新发行。bob电竞安全吗文库包含完整的NIST包,包括抗生素马波沙星、萘E&L、APCI、木耳草素苷黄酮、维甲酸代谢物、fucg - gm1 (d18:1/16:0)糖脂等化合物。它被细分为几个光谱库:

  • NIST / EPA / NIH质谱库:该释放含有350,704电子电离(EI)光谱(306,643化合物,43,774重复光谱) - 比NIST17增加39,729个化合物
  • 气相色谱保留指数和方法库:这包含了447289保留指数(RI)值的139,382个化合物,增加了40K化合物。此外,还包括了114,629个具有RI和MS的化合物
  • 小分子的NIST串联质谱库:这含有来自30,999种化合物的185,608个前体离子的1,320,389个光谱
详情请参阅NIST20: NIST串联和电子电离谱库更新nist.gov
除原始NIST搜索软件旁边以评估和使用库(MS解释器和混合搜索)。小分子高分辨率精确质量(HRAM)MS / MS库以Bruker特定的格式格式化,可由软件直接读取bob电竞安全吗MetaboScape®2021年,更高,DataAnalysis 5.2和更高。它包含在高分辨率精确质量(HRAM)模式下获得的27840种化合物的MS / MS光谱。

Преимушества.

bob电竞安全吗Bruker Metabolomics光谱库

从样品到知识:通过正确的化合物鉴定,创造更深入的代谢组学见解

代谢物由覆盖宽动态范围的小分子的复杂混合物组成。随着可检测物质的数量持续增长以包括哺乳动物,微生物和基于植物的内源性和外源代谢物,鉴定对于完全理解代原数据的生物学背景是必不可少的。

因此,先前描述的已知目标代谢物的注释,称为重复,变得至关重要,必须是自动和结论性的。
如果化合物以高信心鉴定化合物,只能获得生物学背景下的有意义的见解。通过匹配储存在数据库中的不同标准和含有相关内源和外源代谢物的光谱文库来获得这种置信度。

这些信息可以从布鲁克的高质量LC-MS/MS数据中获得bob电竞安全吗QTOF仪器与自信识别的光谱库相匹配,包括精确的前体质量和同位素图案,MS / MS光谱和保留时间信息,以及CCS值。MetaboScape®允许根据用户可定义的阈值级别匹配此信息。图形化的Annotation Quality“AQ”表示使分析人员能够很容易地评估他们对MetaboScape中自动生成的每个注释的信心®

注释质量的象征

用于快速和自信的代谢物无限全体的集成解决方案

完全集成的元标记支持了几个互补频谱库®为已知化合物的自动和积极的识别工作流程解决方案。这些代谢物库包括Bruker HMDB代谢物库、Bruker Metabob电竞安全吗boBASE®个人图书馆,布鲁克MetaboBASbob电竞安全吗E®植物库,布鲁克NIST光谱库,bob电竞安全吗进一步公共和定制库。

这些光谱库存储在您的PC上,提供本地搜索功能,提供性能和自始至终,并消除隐私问题。

Применения.

bob电竞安全吗Bruker Metabolomics光谱库

谱库搜索

为了鉴定代谢物,需要收集所有可用的信息。这包括从纯标准的片段光谱与从代谢组学样品获得的光谱的比较。具体的片段质量和强度分布有助于有价值的代谢物鉴定。

使用频谱库内容使用该频谱库内容MetaboScape®软件bob电竞安全吗Bruker Dataanalysis.(除非另有说明)。两者都可以在本地pc上运行,并提供私人搜索功能。此外,这两种软件解决方案都旨在创建自定义库并将其导出为ASCII格式。这允许分享图书馆与开源格式的同事。

光谱库编辑器

构建自己的质谱/质谱库很容易与布鲁克库编辑器。bob电竞安全吗扩大现有复合光谱的覆盖范围,或通过进一步的参考测量,例如不同的碰撞能量来补充现有的信息。库光谱测量在多重碰撞能量,确保自动和高置信识别范围广泛的代谢物。

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