自信的识别
布鲁克质谱仪器专用图书馆bob电竞安全吗
质谱库包含相关的内源性和外源性代谢物,使您能够与实验MS/MS光谱进行自动重复。这些光谱库中所含化合物的数量是一个重要因素,近年来不断增长,使越来越多的已知代谢物得以鉴定。
这在新版本的bob电竞安全吗力量MetaboBASE®私人图书馆3.0。它包含:
的力量Mbob电竞安全吗etaboBASE®个人图书馆3.0由著名的Gary Siuzdak教授和Paul Benton博士提供。
*METLIN™是斯克里普斯研究所的商标。
注:Bruker Mbob电竞安全吗etaboBASE®个人库3.0仅支持MetaboScape®4.0甚至更高。
不仅光谱的数量很重要,而且库中所包含的数据的质量也很重要,这对有把握的鉴定非常重要。
所有光谱包含在bob电竞安全吗布鲁克HMDB代谢物库2.0是手动检查去除噪声光谱和污染峰。对前体离子和片段离子的质量进行了修正,使其符合理论质量值和同位素分布。
这个光谱库的第二个版本提供了更多6000 MS / MS以上的光谱800种化合物从人类代谢组数据库(HMDB)和保留时间信息中选择。Bruker HMDB代谢bob电竞安全吗物库2.0的数据采用纯参考标准获取。所有化合物都在碰撞系列QTOF高分辨率质谱仪上使用5种不同的碰撞能级进行测量。
保留时间信息为大约600种代谢物的反相LC增加了进一步的正交信息,以增加在尿液、血液和其他生物液体中发现的代谢物的识别的信心。
的T-ReX洗脱物代谢组学试剂盒:RP是一个专用R埃弗斯-P有LC柱套件,使保留时间匹配到布鲁克HMDB代谢物库2.0中的相应值。bob电竞安全吗它还包含LC-MS/MS数据采集的方法和标准操作程序(sop),是完整的一部分
霸王龙LC-QTOF简化非靶向代谢组学的解决方案。
Brukbob电竞安全吗er HMDB代谢物库由Bruker独家提供,并与加拿大阿尔伯塔大学的李亮教授和David Wishart教授及其团队合作生成。
光谱是使用商业标准和假定确定的代谢物发现的模式豆科植物,苜蓿。这使植物和食品研究中的代谢物鉴定成为可能。Brukbob电竞安全吗er Sumner metabbase®植物库还包含了84个化合物的228个光谱,经MS和NMR鉴定。
最近在Bruker timsTOF仪器上获得的超过150种化合物的碰撞截面(CCS)值使捕获离子迁移率分离得到的正交信息匹配成为可能。bob电竞安全吗这允许基于CCS值、前驱体质量和同位素模式、保留时间和MS/MS谱来识别化合物。谱库包含在多个碰撞能量下获得的谱,并且是在ESI负离子模式下获得的。大多数化合物的分子式、结构以*表示。提供了mol格式、InChI格式和SMILES格式。
的bob电竞安全吗Bruker NIST 2020质谱库是国家标准与技术研究所(NIST)的一个产品,由布鲁克重新发布。bob电竞安全吗该库包含完整的NIST包,涵盖了马博沙星抗生素、萘E&L、APCI、木犀草素苷黄酮、维甲酸代谢物、Fuc-GM1(d18:1/16:0)糖脂等化合物。它被细分为几个光谱库:
代谢组由复杂的小分子混合物组成,覆盖广泛的动态范围。随着可检测物质的数量继续增长,包括哺乳动物,微生物,和植物为基础的内源性和外源性代谢物,识别是必要的,以充分理解代谢组数据的生物学背景。
因此,先前描述的已知目标代谢物的注释(称为重复)变得至关重要,必须是自动的和结论性的。
只有在化合物被高度确定的情况下,才能在生物学背景下获得有意义的见解。这种可信度是通过匹配存储在数据库和包含相关内源性和外源性代谢物的谱库中的不同标准来获得的。
信息可以从您的布鲁克上获得的高质量LC-MS/MS数据bob电竞安全吗QTOF仪器并匹配到谱库进行自信识别,包括准确的前体质量和同位素模式、MS/MS光谱和保留时间信息以及CCS值。MetaboScape®启用根据用户定义的阈值级别匹配此信息。图形化的注释质量“AQ”表示使分析人员能够方便地评估MetaboScape中自动生成的每个注释的置信度®.
完全集成的MetaboScape支持几个互补的光谱库®为已知化合物的自动和积极识别的工作流程解决方案。这些代谢物库包括Bruker HMDB代谢物库、Bruker Metabob电竞安全吗boBASE®个人图书馆,Bruker Metabbob电竞安全吗oBASE®植物库,布鲁克NIST光谱库,bob电竞安全吗以及进一步的公共和定制库。
这些光谱库存储在您的PC上,提供本地搜索功能,以提供性能和全程搜索,并消除隐私问题。
为了鉴别代谢物,需要收集所有可用的信息。这包括从纯标准的片段光谱与从代谢组学样品获得的光谱的比较。特定片段质量和强度分布对代谢物的鉴定有重要贡献。
方法查询谱库内容MetaboScape®软件或bob电竞安全吗力量DataAnalysis(除非另有说明)。两者都在本地pc上运行,并提供私人搜索功能。此外,两种软件解决方案都是为创建而设计的自定义库专利化合物,并将它们导出为ASCII格式。这允许共享库以开源的形式与同事交流。
使用Bruker库编辑器可以很容易地构建自己的MS/MS谱库。bob电竞安全吗扩展现有化合物光谱的覆盖范围或补充现有信息的进一步参考测量,例如从不同的碰撞能量。在多个碰撞能量下测量的库谱确保了广泛的代谢物的自动和高置信度识别。
仅供研究用途。不用于临床诊断程序。