光谱库

bob电竞安全吗布鲁克代谢组学谱库

通过正确的化合物识别和定制的光谱库,创建更深层次的代谢组学见解

自信的识别

布鲁克质谱仪器专用图书馆bob电竞安全吗

做marquants

MS / MS谱库

化合物鉴定的高置信度谱库

信心
在布鲁克质谱仪上测定了参考化合物的高质量质谱。bob电竞安全吗
识别
MS/MS光谱匹配和精确的前体信息允许识别已知化合物。
知识的获得
了解更多关于样品中检测到的化合物的信息。
全面的
bob电竞安全吗Bruker MS/MS谱库包含数十万种化合物的信息。

的特性

bob电竞安全吗布鲁克代谢组学谱库

bob电竞安全吗力量MetaboBASE®私人图书馆3.0

质谱库包含相关的内源性和外源性代谢物,使您能够与实验MS/MS光谱进行自动重复。这些光谱库中所含化合物的数量是一个重要因素,近年来不断增长,使越来越多的已知代谢物得以鉴定。

这在新版本的bob电竞安全吗力量MetaboBASE®私人图书馆3.0。它包含:

  • 从著名的METLIN(*)化合物库中提取的超过100,000个合成或分离的标准物,包括二肽和三肽,以及内源性和外源性代谢物,用于研究生物系统中发生的变化。这些数据是在QTOF仪器上获得的。在布鲁克QTOF仪器上获得了超过14000个数据。bob电竞安全吗
  • 在硅片中产生的MS/MS光谱超过233000种化合物在这个库中,为尚未作为纯参考标准提供的相关指标的更快的初步鉴定铺平了道路。
在不同的碰撞能量下,用正模式和负模式测量所有光谱,丢弃质量差的光谱。硅内库的碰撞能量分别为10、20和40 eV,其他的为10/25和25/50 eV。
补充光谱数据包括InCHi、SMILES和CAS标识符和大多数物质的同义词。数据库id和到外部数据库(包括HMDB、METLIN和PubChem)的超链接可以让您快速将已识别的代谢物带入生物环境。



的力量Mbob电竞安全吗etaboBASE®个人图书馆3.0由著名的Gary Siuzdak教授和Paul Benton博士提供。

*METLIN™是斯克里普斯研究所的商标。


注:Bruker Mbob电竞安全吗etaboBASE®个人库3.0仅支持MetaboScape®4.0甚至更高。

bob电竞安全吗布鲁克HMDB代谢物库2.0

不仅光谱的数量很重要,而且库中所包含的数据的质量也很重要,这对有把握的鉴定非常重要。
所有光谱包含在bob电竞安全吗布鲁克HMDB代谢物库2.0手动检查去除噪声光谱和污染峰。对前体离子和片段离子的质量进行了修正,使其符合理论质量值和同位素分布。

这个光谱库的第二个版本提供了更多6000 MS / MS以上的光谱800种化合物从人类代谢组数据库(HMDB)和保留时间信息中选择。Bruker HMDB代谢bob电竞安全吗物库2.0的数据采用纯参考标准获取。所有化合物都在碰撞系列QTOF高分辨率质谱仪上使用5种不同的碰撞能级进行测量。

保留时间信息为大约600种代谢物的反相LC增加了进一步的正交信息,以增加在尿液、血液和其他生物液体中发现的代谢物的识别的信心。

T-ReX洗脱物代谢组学试剂盒:RP是一个专用R埃弗斯-P有LC柱套件,使保留时间匹配到布鲁克HMDB代谢物库2.0中的相应值。bob电竞安全吗它还包含LC-MS/MS数据采集的方法和标准操作程序(sop),是完整的一部分


霸王龙LC-QTOF简化非靶向代谢组学的解决方案。

Brukbob电竞安全吗er HMDB代谢物库由Bruker独家提供,并与加拿大阿尔伯塔大学的李亮教授和David Wishart教授及其团队合作生成。

bob电竞安全吗力量MetaboBASE®植物库

光谱是使用商业标准和假定确定的代谢物发现的模式豆科植物,苜蓿。这使植物和食品研究中的代谢物鉴定成为可能。Brukbob电竞安全吗er Sumner metabbase®植物库还包含了84个化合物的228个光谱,经MS和NMR鉴定。

最近在Bruker timsTOF仪器上获得的超过150种化合物的碰撞截面(CCS)值使捕获离子迁移率分离得到的正交信息匹配成为可能。bob电竞安全吗这允许基于CCS值、前驱体质量和同位素模式、保留时间和MS/MS谱来识别化合物。谱库包含在多个碰撞能量下获得的谱,并且是在ESI负离子模式下获得的。大多数化合物的分子式、结构以*表示。提供了mol格式、InChI格式和SMILES格式。

bob电竞安全吗Bruker NIST 2020质谱库

bob电竞安全吗Bruker NIST 2020质谱库是国家标准与技术研究所(NIST)的一个产品,由布鲁克重新发布。bob电竞安全吗该库包含完整的NIST包,涵盖了马博沙星抗生素、萘E&L、APCI、木犀草素苷黄酮、维甲酸代谢物、Fuc-GM1(d18:1/16:0)糖脂等化合物。它被细分为几个光谱库:

  • NIST/EPA/NIH质谱库:该版本包含350704个电子电离(EI)光谱(306,643个化合物,43,774个重复光谱)-比NIST17增加了39,729个化合物
  • 气相色谱保留指数和方法库:包含了139,382个化合物的447,289个保留指数(RI)值,增加了40K化合物。另有114,629个化合物同时具有RI和MS
  • NIST小分子串联质谱库:包含来自30999个化合物的185,608个前体离子的1,320,389个光谱
详细描述请参阅NIST20:更新的NIST串联和电子电离谱库nist.gov
旁边的原始NIST搜索软件评估和使用库(MS解释器和混合搜索)。小分子高分辨率精确质量(HRAM) MS/MS库按布鲁克特定格式格式化,以便软件直接可读bob电竞安全吗MetaboScape®2021年及更高版本,DataAnalysis版本5.2及更高版本。它包含了27840种化合物在高分辨率精确质量(HRAM)模式下的MS/MS光谱。

优点之一

bob电竞安全吗布鲁克代谢组学谱库

从样品到知识:通过正确的化合物识别创造更深层次的代谢组学见解

代谢组由复杂的小分子混合物组成,覆盖广泛的动态范围。随着可检测物质的数量继续增长,包括哺乳动物,微生物,和植物为基础的内源性和外源性代谢物,识别是必要的,以充分理解代谢组数据的生物学背景。

因此,先前描述的已知目标代谢物的注释(称为重复)变得至关重要,必须是自动的和结论性的。
只有在化合物被高度确定的情况下,才能在生物学背景下获得有意义的见解。这种可信度是通过匹配存储在数据库和包含相关内源性和外源性代谢物的谱库中的不同标准来获得的。

信息可以从您的布鲁克上获得的高质量LC-MS/MS数据bob电竞安全吗QTOF仪器并匹配到谱库进行自信识别,包括准确的前体质量和同位素模式、MS/MS光谱和保留时间信息以及CCS值。MetaboScape®启用根据用户定义的阈值级别匹配此信息。图形化的注释质量“AQ”表示使分析人员能够方便地评估MetaboScape中自动生成的每个注释的置信度®

注释质量的象征

快速可靠的代谢物去除综合解决方案

完全集成的MetaboScape支持几个互补的光谱库®为已知化合物的自动和积极识别的工作流程解决方案。这些代谢物库包括Bruker HMDB代谢物库、Bruker Metabob电竞安全吗boBASE®个人图书馆,Bruker Metabbob电竞安全吗oBASE®植物库,布鲁克NIST光谱库,bob电竞安全吗以及进一步的公共和定制库。

这些光谱库存储在您的PC上,提供本地搜索功能,以提供性能和全程搜索,并消除隐私问题。

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谱库搜索

为了鉴别代谢物,需要收集所有可用的信息。这包括从纯标准的片段光谱与从代谢组学样品获得的光谱的比较。特定片段质量和强度分布对代谢物的鉴定有重要贡献。

方法查询谱库内容MetaboScape®软件bob电竞安全吗力量DataAnalysis(除非另有说明)。两者都在本地pc上运行,并提供私人搜索功能。此外,两种软件解决方案都是为创建而设计的自定义库专利化合物,并将它们导出为ASCII格式。这允许共享库以开源的形式与同事交流。

光谱库编辑器

使用Bruker库编辑器可以很容易地构建自己的MS/MS谱库。bob电竞安全吗扩展现有化合物光谱的覆盖范围或补充现有信息的进一步参考测量,例如从不同的碰撞能量。在多个碰撞能量下测量的库谱确保了广泛的代谢物的自动和高置信度识别。

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