代谢组学方法

霸王龙®LC-QTOF解决方案

因为每一步都很重要……

简化的霸王龙®LC-QTOF代谢组学方法

几个关键步骤对于确定与动态代谢过程相关的化合物非常重要;包括样品制备、数据采集和数据评价。只有在所有这些工作流程步骤都得到控制的情况下,才能在生物学背景下获得有意义的见解。为了简化和协调这些,布鲁克与加拿大阿尔伯塔大学的李亮教授和他的团队bob电竞安全吗合作,开发了霸王龙®LC-QTOF解决方案。

“霸王龙……®LC-QTOF解决方案“包括为研究人员在非靶向代谢组学方面提供领先优势的一切

关键的第一步一道代谢组学是一种可重复的样品制备。因此,作为代谢组学解决方案的一部分,提供了用于制备典型临床研究样本(包括尿液和血浆)的标准操作程序(sop)。

高质量的LC-MS/MS数据的获取遵循非靶向代谢组学工作流程中的样品制备,使用T-ReX®LC-QTOF解决方案,无需LC-MS/MS参数优化。分析需要较高保留时间稳定性的大样本队列洗提UHPLC与专门的霸王龙相结合®洗脱代谢组学试剂盒:RP提供。反相LC柱套件能够匹配保留时间的值bob电竞安全吗布鲁克HMDB代谢物库2.0.的影响二世MS/MS数据采集采用优化的参数,其稳健的性能是高质量数据采集的基础,可以对复杂样本进行广泛的剖面研究。

在数据采集之后,MetaboScape®软件提供了简化的数据评估,能够自动和自信地识别相关的已知化合物:

  • 独特的霸王龙®三维特征提取技术是后续代谢产物识别和统计数据评价的关键。通过自动进行无参数保留时间比对和区域完全提取,提取所有相关信息,使代谢物识别更加自信,同时降低统计分析的假阴性率。
  • 硅化物在布鲁克中产生MS/MS光谱bob电竞安全吗MetaboBASE®私人图书馆3.0可试探性地确定尚未作为纯参考标准的有关指标。
  • 注释质量(AQ)评分提供了一个快速的概述,给出了每个注释参数的可信度。
  • 通路映射功能可以将已识别的化合物设置到生物环境中。

“我们很高兴能与布鲁克合作,制作全面的bob电竞安全吗霸王龙®LC-QTOF解决方案.完整的开箱即用的解决方案为相关的已知内源性代谢物的高置信度识别提供了基础,并能够使用通路映射将这些设置到生物环境中。这种解决方案将为研究人员在尿液或血浆等典型研究样本的非靶向代谢组学方面提供一个领先的起点。”

李亮博士,加拿大阿尔伯塔大学化学系教授

mrm aXelerate

磁共振质谱(MRMS)表型分析

通过UHPLC-QTOF-MS/MS分析,可以对复杂混合物进行深层代谢分析,以发现表型背景下的代谢组学。通常不同的LC方法和在正离子和负离子模式下的数据采集相结合,这是有成本的;分析每个样品所需的时间。
磁共振质谱(MRMS)极限分辨率通过省去耗时的色谱,加速了表型学和发现代谢组学研究中的样品吞吐量。流动注射分析(FIA)或基于MALDI的工作流程提供了LC-MS分析不容易检测到的化合物的访问,并同时分析已知和未知的代谢物。
对于高通量的需求,如在表型学研究中通常遇到的,UHPLC-QTOF-MS/MS分析由MRMS aXelerate补充,这是一种无lc的MRMS工作流程解决方案,可检测和生成每个样品中> 1000个中-高水平代谢物的分子式,并揭示LC-MS中没有看到的许多额外代谢物,包括极性化合物。通过FIA或MALDI的MRMS分析为复杂样品(如尿液和血浆提取物)的表型分型提供了较高的样品吞吐量。霸王龙强大的数据提取®二维的MetaboScape®提供自动注释的可信度。这是通过<0.2 ppm的质量精度和可超过> 100万的质量分辨率来实现的,从而提高了同位素精细结构的保真度。

在这篇最新的出版物中了解FIA-CASI-MRMS工作流程如何通过与人类代谢组数据库匹配和IFS模式增加2.6倍来帮助解决“暗代谢物质”的探索:一种用于发现代谢组学中精确质量分析的增强同位素精细结构方法:FIA-CASI-FTMS

MRMS极限分辨率使我们能够解决下一代代谢分型问题,即同时快速描述数百个已知和数千个与动态生物/化学过程相关的新代谢产物。MRMS与MetaboScape的结合也将使其他研究人员能够在探索“黑暗代谢组”这一新的令人兴奋的研究领域中发光。

Philippe Schmitt-Kopplin教授,分析生物地球化学,Helmholtz中心München,德国