自信的识别
布鲁克质谱仪专用图书馆bob电竞安全吗
质谱库包含相关的内源性和外源性代谢物,使您能够匹配的实验MS/MS谱自动重复。这些光谱库中所包含的化合物的数量是一个重要因素,近年来不断增加,使鉴定出越来越多的已知代谢物。
例如,新版本的bob电竞安全吗力量MetaboBASE®私人图书馆3.0。它包含:
的力量Mbob电竞安全吗etaboBASE®个人图书馆3.0由著名的Gary Siuzdak教授和Paul Benton博士提供。
*METLIN™是斯克里普斯研究所的商标。
注:Bruker Mbob电竞安全吗etaboBASE®个人库3.0只支持MetaboScape®4.0甚至更高。
重要的不仅仅是光谱的数量,还有库中包含的数据的质量,这对于有信心的识别是非常重要的。
的所有光谱bob电竞安全吗Bruker HMDB代谢物库2.0是手动检查去除噪声光谱和污染峰。前驱体离子和碎片离子的质量经过修正,符合理论质量值和同位素模式分布。
这个光谱库的第二个版本提供了更多6000 MS / MS以上光谱800种化合物从人类代谢组数据库(HMDB)和保留时间信息中选择。Bruker HMDB代谢bob电竞安全吗物库2.0的数据使用纯参考标准获得。所有化合物都在冲击系列QTOF高分辨率质谱仪上测量,使用5种不同的碰撞能级。
保留时间信息对于大约600个代谢物的反相液相色谱增加了进一步的正交信息,以增加在诸如尿液、血液和其他生物液体中发现的代谢物鉴定的可信度。
的T-ReX洗脱代谢组学试剂盒:RP是一个专用R埃弗斯-P相LC柱套件,使匹配保留时间相应的值在布鲁克HMDB代谢物库2.0。bob电竞安全吗它还包含LC-MS/MS数据采集的方法和标准操作程序(sop),是完整的一部分
霸王龙LC-QTOF简化非靶向代谢组学的解决方案。
布鲁克Hbob电竞安全吗MDB代谢物库由布鲁克独家提供,并与加拿大阿尔伯塔大学的李亮教授、David Wishart教授及其团队合作生成。
光谱是使用商业标准和假定确定的代谢物发现在模型豆科植物,截断紫花苜蓿。这使植物和食品研究中的代谢物的鉴定成为可能。布鲁克萨bob电竞安全吗姆纳MetaboBASE®植物库还包含84种化合物的228个光谱,经MS和NMR鉴定。
最近在Bruker timsTOF仪器上获得了150多个化合物的碰撞截面(CCS)值,使从捕获离子迁移率分离中获得的正交信息能够匹配。bob电竞安全吗这允许根据CCS值、前驱体质量和同位素模式、保留时间和MS/MS光谱来鉴别化合物。光谱库包含了多次碰撞能量下获得的光谱,这些光谱是在ESI负离子模式下获得的。对于大多数化合物的分子式,其结构为*。mol格式、InChI和SMILES。
的bob电竞安全吗布鲁克NIST 2020质谱库是美国国家标准与技术协会(NIST)的产品,由布鲁克重新发行。bob电竞安全吗文库包含完整的NIST包,包括抗生素马波沙星、萘E&L、APCI、木耳草素苷黄酮、维甲酸代谢物、fucg - gm1 (d18:1/16:0)糖脂等化合物。它被细分为几个光谱库:
代谢组由覆盖广泛动态范围的小分子的复杂混合物组成。随着可检测物质的数量不断增加,包括哺乳动物、微生物和植物的内源性和外源性代谢物,识别对于充分理解代谢组学数据的生物学背景至关重要。
因此,先前描述的已知目标代谢物的注释,称为重复,变得至关重要,必须是自动和结论性的。
只有对化合物进行高可信度的鉴定,才能在生物学背景下获得有意义的见解。该置信度是通过匹配存储在包含相关内源性和外源性代谢物的数据库和光谱库中的不同标准获得的。
这些信息可以从布鲁克的高质量LC-MS/MS数据中获得bob电竞安全吗QTOF仪器与光谱库相匹配的可靠识别包括准确的前体质量和同位素模式、MS/MS光谱和保留时间信息以及CCS值。MetaboScape®允许根据用户可定义的阈值级别匹配此信息。图形化的Annotation Quality“AQ”表示使分析人员能够很容易地评估他们对MetaboScape中自动生成的每个注释的信心®.
在完全集成的MetaboScape中支持几个互补的光谱库®为已知化合物的自动和积极的识别工作流程解决方案。这些代谢物库包括Bruker HMDB代谢物库、Bruker Metabob电竞安全吗boBASE®个人图书馆,布鲁克MetaboBASbob电竞安全吗E®植物库,布鲁克NIST光谱库,bob电竞安全吗进一步公共和定制库。
这些光谱库存储在您的PC上,提供本地搜索功能,提供性能和自始至终,并消除隐私问题。
为了鉴定代谢物,需要收集所有可用的信息。这包括从纯标准的片段光谱与从代谢组学样品获得的光谱的比较。具体的片段质量和强度分布有助于有价值的代谢物鉴定。
利用该方法对谱库内容进行查询MetaboScape®软件或bob电竞安全吗力量DataAnalysis(除非另有说明)。两者都可以在本地pc上运行,并提供私人搜索功能。此外,这两种软件解决方案都旨在创建自定义库并将其导出为ASCII格式。这允许共享库以开放源码格式与同事进行交流。
构建自己的质谱/质谱库很容易与布鲁克库编辑器。bob电竞安全吗扩大现有复合光谱的覆盖范围,或通过进一步的参考测量,例如不同的碰撞能量来补充现有的信息。库光谱测量在多重碰撞能量,确保自动和高置信识别范围广泛的代谢物。
仅供研究使用。不适用于临床诊断程序。