猎枪蛋白质识别

深度和速度:猎枪蛋白质组学的突破

突破猎枪蛋白质组学

深度和速度:猎枪蛋白质组学的突破

自下而上的蛋白质识别一直是要求最高的任务之一生物实验,女士要求峰容量、速度和灵敏度尽可能多的肽序列的高度复杂的混合消化蛋白质。独特的困离子迁移谱法(蒂姆)能力timsTOF职业增加了一个额外维度的分离,导致前所未有的峰容量和敏感性和启用PASEF®(并行积累串行碎片)工作流> 100 hz MS / MS没有灵敏度和分辨率损失,同时操作责任周期的100%。

TIMS-PASEF解决方案

的TIMS-PASEF®解决方案

一个复杂问题
在一个典型的猎枪蛋白质组学实验,从超过一百万proteoforms肽,掩盖在浓度由10个数量级nano-LC梯度通常使用2小时。这是一个重大的挑战的质谱仪必须检测,隔离和碎片尽可能多的数以百万计的产生的肽。产生广泛的蛋白质识别信息,添加离子迁移率作为额外维度的分离,有可能大大增加峰值容量。然而,这不能速度或损害的敏感性。

TIMS-PASEF®
蒂姆斯使PASEF的独特设计®离子的方法集中包洗提离子迁移细胞宽度的2 - 5 ms使ms / ms收购速度> 100赫兹和工作周期接近100%。额外的分离是取得的增加速度和灵敏度,而TOF分析器允许维持一个超高分辨率MS / MS MS和MS / MS速度。

并行串行碎片积累(PASEF®)。PASEF®策略在timsTOF专业仪器,离子积累而第二个蒂姆斯地区连续洗脱肽的物种。

PASEF®深的蛋白质组学研究

与PASEF timsTOF Pro®导致异常蛋白质识别性能和深度的分析。当加上nanoElute nano-flow UHPLC和CaptiveSpray离子源timsTOF Pro可以定期识别超过5000个蛋白质组织从200 ng的海拉细胞消化分离90分钟梯度。

PASEF®增加吞吐量的猎枪蛋白质组学
惊人的速度可以用来减少梯度时间和增加吞吐量,同时保持前所未有的深度分析。接近4000蛋白质组可以确定从100 ng 30分钟的海拉细胞消化分离梯度。

标准PASEF®方法:一个包含10个1.1秒周期蒂姆斯分离事件。平均12 MS / MS执行在每个蒂姆斯分离事件。

PASEF®增加蛋白质识别灵敏度

卓越的敏感性增加,来源于商旅分离使低浓度样品的新可能性。使用标准的PASEF®与其他调优方法,,12 ng的海拉细胞消化分离60分钟梯度确定超过2900蛋白质组。

临床蛋白质组学的最理想的伙伴
PASEF®最后允许临床蛋白质组学成为现实。的组合系统的速度和灵敏度可再生产地标识在1400海拉细胞蛋白质组从50 ng注射用5分钟梯度分离。

Label-free three-proteome混合物的量化结果。总蛋白质负载150 ng, 90分钟梯度分离。MaxQuant用于处理。