代谢组学方法

T-ReX®LC-QTOF解决方案

因为每一步都很重要……

简化的霸王龙®LC-QTOF代谢组学溶液

几个关键步骤对于自信地确定与动态代谢过程相关的化合物是重要的;包括样品制备、数据采集和数据评价。只有在所有这些工作流步骤都得到控制的情况下,才能获得生物学环境中有意义的见解。为了简化和协调这些,布鲁克与加拿大阿尔伯塔大学的李亮教授及其团队合bob电竞安全吗作开发了T-ReX®LC-QTOF解决方案。

“霸王龙……®LC-QTOF解决方案“包括一切,为研究人员提供非靶向代谢组学的领先优势

关键的第一步一道代谢组学是一种可重复的样品制备。因此,作为代谢组学解决方案的一部分,提供了用于制备典型临床研究样本(包括尿液和血浆)的标准操作程序(sop)。

在非靶向代谢组学工作流程中,使用T-ReX进行样品制备后,获得高质量的LC-MS/MS数据®LC-QTOF解决方案,无需LC-MS/MS参数优化。分析需要高保留时间稳定性的大样本群体洗提UHPLC再加上专门的霸王龙®洗脱代谢组学试剂盒:RP提供。反相LC柱套件使保留时间的值匹配bob电竞安全吗布鲁克HMDB代谢物库2.0。的影响二世MS/MS数据采集使用优化的参数,其强大的性能是高质量数据采集的基础,使复杂样品的广泛分析研究成为可能。

数据采集完成后MetaboScape®软件提供简化的数据评估,实现相关已知化合物的自动和自信鉴定:

  • 独特的霸王龙®三维特征提取技术是后续代谢物鉴定和统计数据评价的关键。通过自动进行无参数保留时间比对和区域完整提取,提取所有相关信息,使代谢物鉴定更加可信,同时降低统计分析中的假阴性率。
  • bob电竞安全吗布鲁克HMDB代谢物库2.0作为代谢组学解决方案的一部分,提供bbb800代谢物的MS/MS谱,并提供bbb600相关代谢物的保留时间信息。该文库是确定相关标记的先决条件。
  • 计算机生成的质谱/质谱在布鲁克bob电竞安全吗MetaboBASE®个人图书馆3.0能够初步确定尚未作为纯参考标准的相关指标。
  • 注释质量(AQ)评分提供了对每个注释参数的快速概述。
  • 通路映射功能可以将已识别的化合物设置为生物环境。

“我们很高兴能与布鲁克合作,共同完成这一综合性项目bob电竞安全吗霸王龙®LC-QTOF解决方案。完整的开箱即用解决方案为相关已知内源性代谢物的高置信度鉴定提供了基础,并能够使用途径映射将这些代谢物设置为生物学背景。该解决方案将为研究人员在非靶向代谢组学方面提供一个领先的起点,用于尿液或血浆等典型研究样本。”

李亮博士,加拿大阿尔伯塔大学化学教授

mrm aXelerate

磁共振质谱(MRMS)表型分析

通过UHPLC-QTOF-MS/MS分析,可以对表型背景下的复杂混合物进行深度代谢分析,以发现代谢组学。通常,不同的LC方法和正负离子模式下的数据采集相结合,这是有成本的;分析每个样品所需的时间。
磁共振质谱(MRMS)极高的分辨率通过省去耗时的色谱法,加速了表型组学和发现代谢组学研究中的样品通量。流动注射分析(FIA)或基于MALDI的工作流程提供了不易被LC-MS分析检测到的化合物,并同时分析已知和未知的代谢物。
对于高通量需求,正如在表型组学研究中通常遇到的那样,UHPLC-QTOF-MS/MS分析由MRMS aXelerate补充,MRMS aXelerate是一种无lc的MRMS工作流程解决方案,可以检测并生成每个样品中1000个中高水平代谢物的分子式,并显示许多LC-MS中未见的额外代谢物,包括极性化合物。通过FIA或MALDI的MRMS分析为复杂样品(如尿液和血浆提取物)的表型分析提供了高样品通量。霸王龙强大的数据提取能力®二维的MetaboScape®提供对自动注释的信心。这是通过<0.2 ppm的质量精度和可超过100万的质量分辨率来实现的,从而提高了同位素精细结构的保真度。

在这篇最近的出版物中了解FIA-CASI-MRMS工作流程如何通过与人类代谢组数据库的匹配增加2.6倍和IFS模式的增加来帮助解决阐明“暗代谢物质”的问题。一种用于发现代谢组学精确质量分析的增强同位素精细结构方法:FIA-CASI-FTMS

“MRMS eXtreme Resolution使我们能够解决下一代代谢分型问题,即同时快速描述数百种已知和数千种与动态生物/化学过程相关的新代谢物。MRMS与MetaboScape的结合也将使其他研究人员能够在探索“黑暗代谢组”这一令人兴奋的新研究领域中发挥作用。

Philippe Schmitt-Kopplin教授,分析生物地球化学,德国亥姆霍兹中心,德国