Paser 2022

通过集成Paser提供的实时数据库搜索和智能获取来打破数据分析瓶颈

普遍可用

• 所有当前和未来的Timstof Pro和Flex平台都是可访问的Paser
  

4D-Proteomics™

• CCS感知数据很丰富，即使是实时数据库搜索功能也是一种现实，包括PASER，包括PTMS等PTM

与GPU功率的大规模平行化

• Paser是GPU驱动的，在数千个CUDA核心上提供了巨大的计算功率

Paser数据审查

• 从高级实验信息到特定的片段离子光谱，从所有PASER盒上的集成查看器信心查看您的数据的复杂细节到特定的片段离子光谱

• PASER很聪明，在样品采集结束时用户定义的蛋白质或肽的资格决定了样品队列的进展，这可以检查适用性，节省珍贵的样品，昂贵的消耗品和仪器时间
  

• 不再担心注入那些珍贵的样品。
  
• 不再担心浪费的乐器时间。
  
• 不再担心那些具有昂贵的试剂和样品准备的样品，只是在表现不佳的系统中注入。
  
• 不再等待QC运行以确定系统适用性。
  
• 在方法开发过程中，不再等待搜索结果。
  
  

TIMSCORE通过为真4D-蛋白质组启用CCS维度提供了最大数量的PSM，肽和蛋白质识别。

Paser搜索算法是正常运行的，与预测和测量的CCS值进行比较，并计算每种光谱的前5个肽候选物的TIMSCORE。在肽验证和错误发现率（FDR）估计步骤中实现了TIMSCORE益处。在非启用CCS的算法中，只能利用两个维度来估计FDR速率，因此，歧视线适合1％的误差（面板A），以区分前进和反向肽的候选者。使用TIMSCORE和额外的CCS尺寸，可以将肽candidations倒在3个维度（面板B）中，从而允许应用一个歧视的轮廓平面以实现相同的1％误差。应用区分平面可提高准确性和精度，有助于验证标准二维中以前得分差的PSM。

Paser 2022能够利用Liley，Rasler和Demichev Labs的流行DIA-NN（​​神经网络）软件的自定义版本处理DIA-PASEF工作流程。TIMS DIAN可以实现可靠，健壮和定量准确的大规模实验。Paser利用相同的DIA-PASEF工作流程，以实时MS进行流式传输，并从收购PC到Paser盒。这些DIA-PASEF数据被处理并存储在PASER盒上。在采集结束时，触发了光谱库搜索，并记录了结果。可以轻松利用TimScore供电的DDA搜索结果来构建光谱库，或者可以从其他流行的工具中导入光谱库。在项目的末尾，用户可以触发匹配 - 跨性别分析以查看各个项目的定量配置文件。这为用户提供了PASEF和DIA-PASEF数据分析的集成环境。

搜索速度毫不妥协的搜索结果。

A）使用Paser进行实时结果的人类细胞裂解物的重复DDA运行的蛋白质ID，并针对最大值进行基准测试

b）使用PASER进行实时结果的人类细胞裂解物的重复DDA运行的肽ID，并针对最大值进行基准测试

c）抑郁剂和最大蛋白质中的97％和近90％的相同肽。

Paser提供了从实时搜索获得的一致结果，与对相同数据的离线搜索相同。由于数据库搜索算法是在GPU上运行的，因此与基于CPU的搜索相比，搜索时间可以忽略不计。

除了实时搜索外，还可以在包括肽组研究在内的特定应用程序中搜索更大的空间，也将成为现实。bob平台靠谱吗针对DDA搜索中的黄金标准的PASER基准测试表现出色或更好。

TIMS VIZ提供了强大的能力，可以像以前从未见过的那样查看4-D蛋白质组学数据。迁移率分离和聚焦于四极和TOF的上游会导致等同质和近同等物种的分离。使用其他技术和PTM富集的情况以及复杂样品的分析，常见的是，在质量共碎片中是同级或等同质量的共同洗脱物种。Pro/Flex的Timstof/Flex首先通过其碰撞横截面分离离子。以前从未有可视化，搜索和分类此类事件的能力。我们称具有不同的移动性值迁移率的等速质量抵消了质量对齐（MOMA），而TIMS可以在复杂的运行中取消此类事件。TIMS允许您将公差设置为酌处权，同时覆盖观察到的Post Database Search的功能和PSM。蒂姆斯（Tims）使您能够查看以前从未知道的东西。